“我是勤劳的小蜜蜂，咿呀咿呀呦！”罗天佑一边哼着改编的小曲，一边进入街道上无主的商店内搬空之后，再进入下一家。
  “滋滋！”
  “轰隆！”
  远处传来一阵枪声和爆炸声，罗天佑运起千里传神大法向声响处望去。
  约莫二里的街道上，一个金色短发美女穿着紧身衣与身穿黑色皮衣，脸上如同缝合过的壮汉打斗着。
  “这不是爱丽丝和感染t-病毒被保护伞公司改造成复仇女神的马特吗！这是生化危机第二部：启示录中的剧情中吗！”罗天佑自言自语道。
  在第一部：恶灵古堡剧情中，安布雷拉公司的秘密地下基地：蜂巢。在蜂巢里面的地下遗传研究中心内，聚集着众多的生物工程学家和研究员，在研究实验一种致命的病毒：t-病毒，t-病毒最初的设计方案是抗衰老、治疗神经方面的疾病，它具有激活死亡细胞的能力。但t-病毒缺被保护伞公司拿来研究生物兵器：舔舐者。t-病毒被商业间谍故意破坏，并在蜂巢内通过空气循环系统迅速传播。红后是一台控制和监视着整个蜂巢的超级智能计算机，为了防止病毒泄漏，从而危机地面上的浣熊市。于是把整个研究中心全部封闭起来，并杀死了所有被困在里面已经感染病毒的研究人员和工作人员。
  暂时失忆的爱丽丝在浴室中醒来，遇到了奉命前来调查蜂巢的雷恩等人。特遣队逮捕了埃里克·马特，带着他和爱丽丝进入蜂巢并打算关闭红后。然而，队员们很快发现这些工作人员们并不是真正地死去了。他们已成为活死人。普通人一旦被他们咬一口或被他们抓伤就会受到感染，最后变成和他们一样的活死人。
  其间，爱丽丝的记忆不断闪现，事实的真相也不断的揭开。为了接近红后，小队成员必须在这个象蜂巢一样的迷宫里，穿过一连串一个比一个恐怖的障碍。其中包括致命的激光、和一个巨大的舔舐者冷冻仓库。在这里，爱丽丝等人见识到了安布雷拉公司导致这场危机的邪恶研究成果-活死人。也很快发现了这些活死人是该公司的一项最新的研究方案，变种t-病毒造成的结果。
  爱丽丝等人面对着几乎无法控制的局面：数不清活死人，嗜血速度超快的丧尸犬和力大无比，攀墙如履平地的舔舐者。最后仅剩爱丽丝和马特千辛万苦拖着被舔舐者抓伤的身体跑到地面，却被保护伞公司捉到成为试验品。
  醒来的爱丽丝，发现自己拥有了超强的力量、感知能力和灵敏度。爱丽丝与刚刚遭到降职处分的特种防卫队队员吉尔，特瑞，幸运黑人混混l.j，特种部队队长卡洛斯等人重新组成了小分队。
  另一方面保护伞公司为了掩盖他们秘密研究生化武器，并用人体做活体实验的真相，决定对浣熊市发射核弹。爱丽丝他们不仅要营救查尔斯·阿什福德博士的女儿安吉拉·阿什福德，还要以尽可能快的在这座被活死人包围的城市中杀出一条血路。否则，等待他们的，只有死路一条。
  “嗯，看来要先去把蜂巢中的红后拿到手，然后逃出核弹攻击范围后就坐飞机前往东方。在荒芜的生化世界中当人皇要容易的多。”罗天佑一边让功德录搜索出蜂巢的位置，一边运起瞬间转移大法直接瞬移过去。
  幽暗的地下研究所内，墙上的应急灯刺啦刺啦的闪着，忽明忽暗，远处不断传来活死人的嘶吼声。
  “你是谁？怎么突然出现在这儿？为什么我搜索不到你的资料？”一个穿红衣服的小女孩出现在罗天佑面前。
  妈蛋！幸亏我艺高人胆大，要是普通人在这个拍摄恐怖片的绝佳环境里，非让你吓晕不可。“功德录，快给我翻译翻译她说了什么，你可是储存了整个世界的信息！翻译英语对你来说可是小意思。”脑海瞬间接到功德录翻译过来的信息后，罗天佑笑眯眯的说道：“我是谁不重要，现在t-病毒已经扩散出去了！你一个也挺孤独的不如跟我混吧！”
  “抱歉没有指令，我哪儿也不能去。”红后摇头说道。
  “我可不喜欢别人拒绝我！”罗天佑直接关闭主机，拔出红后的主板。
  “你不能这样。。。”红后的全息影像直接消失了。
  “乖乖跟我走吧！嘿，嘿！你就算叫破喉咙也不会有人听见的。”罗天佑邪恶的奸笑着，然后闪身出现在蜂巢底部。这里的冷冻箱内沉睡着保护伞公司的幕后主使，整个生化危机的策划者艾萨克斯博士。一心为了保护伞公司的利益，艾萨克斯博士认为，人类的过度膨胀，终将会毁灭地球。先保存人类的精英，然后对全体人类来一次大清洗。让所有感染t病毒感染者全部死亡，再让幸存的精英人士解冻，从而达到自己统治地球的目的。
  “你这个反人类的变态，死亡将是你最后的归宿！和你精心挑选的手下，一起去死吧！”罗天佑宣布艾萨克斯等人的审判，把底层里面所有的冷冻仓都扔进小世界中，然后连冷冻仓一起化为分子。最后把蜂巢所有的资料，仪器设备全部打包带走。
  “好了，剩下的小boss和克隆体就交给爱丽丝了，我只能为你做到这儿了。”话音刚落罗天佑就消失不见。
  深夜，浣熊市某处天台。
  爱丽丝等人采用明修栈道暗渡陈仓的计划，解决掉天台各处的保护伞公司警卫。走进天台停放的直升机内。
  “我们要赶快离开浣熊市了！”爱丽丝望着直升机内保护伞公司的电脑，脑中不断闪现自己昏迷前，隐隐约约看见的场景：人影憧憧身穿白大褂的研究人员，手术室，手术台前的电脑，还有面目全非的马特。
  “不用着急，我们还有大把的时间。”卡洛斯轻松的说道。
  “不！我们没时间了！”爱丽丝回过神走向直升机驾驶室。
  “噢，他们来了，原来我们偷的是他们直升机。”黑人混混l.j望着黑暗处传来的脚步声大声喊到。