随后郑军在台江海域与荷兰军舰展开海战，击沉荷军舰赫克特号，取得台江内海控制权，并同时在北线尾地区击败荷兰陆军，以优势兵力包围普罗民遮城。不久，于四月初五即迫使普罗民遮城守军出降。在取得普罗民遮城做为据点之后，郑军随即由海、陆两面围困热兰遮城。由于考虑到两万大军的粮饷调度不易，郑成功并没有做持久战的打算，一开始即对热兰遮城施压，试图胁迫荷兰军队投降。遭荷兰大员长官揆一拒绝其投降要求之后，郑成功一度下令强攻热兰遮城，却遭遇荷军极顽强抵抗，郑军损失惨重。由于强攻不下，加之大军粮食短缺，使得郑成功被迫改变策略，派出大部分的军队至南北各地屯田、征收钱粮，以解大军乏粮的燃眉之急，对热兰遮城改采长期包围的战略，围城七个月后，荷兰殖民者弃械投降，台湾平。
  1662年（康熙元年、永历十六年）先是郑氏降将海澄公黄梧向当权者鳌拜献策“平贼五策”，自山东至广东沿海迁界，断绝了郑成功的粮饷来源，接着1661年底，郑芝龙一家被弃市于北京，再后来永历帝被吴三桂绞杀于昆明。台湾军民水土不服、人心惶惶，郑成功又严谕金厦诸将迁家眷来台，诸将皆不欲行，离心离德，半年间不发一船至台湾。其子郑经又与乳母私通生子，郑成功内外交困，五月初得急病而亡，死前大喊：“我无面目见先帝于地下”，抓破脸面而死，年仅39岁。
  略过毫无建树的郑克爽不说，郑氏的第三代领导人郑经差其父郑成功远矣！勉强能做个守成之君（三藩反清时，郑军一度占有福建、广东七府之地，后因战略失误，与耿精忠火并，促使其再度降清，最后郑军被赶出大陆，退回台湾。其母董夫人见而责之曰：“七府连败，二岛亦丧，皆由汝无权略果断，不能任人，致左右窃权，各树其党。”郑经无言以对。）
  郑氏领导集团几代领导人交接无不充满了血雨腥风，大大削弱了郑氏军力、民心。
  郑芝龙叛明降清，一部分军队被满清招抚，一部分解散于乡野，导致了郑成功几无可用之兵。
  郑成功薨于台湾，台湾诸将马信、萧拱宸、黄昭等以赐姓弟郑世袭护理国事，谋自立，报至思明州，郑泰、洪旭、黄廷、冯世澄等拥立世子郑经继位。后来，郑经虽然打败了拥立郑世袭的台湾诸将，入主台湾，但郑军之间的内讧，造成了郑氏集团实力大降，大批的官兵军民投降清朝。
  郑经死后，子郑克臧和郑克爽兄弟争嗣，又掀起了一场军队大清洗，实力大损的台湾很快被清将施琅攻克，郑氏集团割据海疆的历史正式结束。
  朱钰思索良久，永历帝已崩，待郑成功薨后，张煌言等期望郑经同自己一起拥立鲁监国朱以海，但郑经完全没有继续打算抗反清复明这面大旗的意思，很快朱以海会死于金门，张煌言对前途完全绝望，多次拒绝清廷的招降，解散军队，隐居于浙江沿海海岛，后被清浙江总督张杰所俘，拒降，英勇就义于杭州。
  郑经面对清廷的招抚，曾提出愿依朝鲜例，被清廷拒绝。其入台后，俨然把台湾经营成一个独立王国，不再有反清复明的壮志，只求苟安于一隅，像郑军元老黄廷有感反清复明无望，后来就率军数万民降清。
  朱钰暗暗下定决心，郑经小儿，沉溺于女色，偏安于一隅，成不了大事，看来反清复明这杆大旗要换个人来扛了。
  朱钰带着陈绳武返回铜山之际，前去与陈永华道别，说道：“陈兄，永历帝既被缅酋执于吴藩，想必命不久矣！国无一主，社稷倾覆，惜我大明百姓如此多灾多难！”
  陈永华道：“愚兄亦有此忧，此时我军中大明宗室近枝唯有鲁王朱以海和宁靖王朱术桂，不知延平王爷会奉哪位为帝。”
  朱钰心道：“王爷没这个时间了，就是有的话，他也只会遥尊不会近奉！”郑成功要的是一面反清复明的大旗，来实现自己的抱负，绝非要真正给自己找个皇帝，后来郑经也是这个思路，永历死后，仍奉永历年号，而不尊身边的鲁王、宁靖王为帝。
  朱钰作揖道：“不管如何，兄弟我这就回铜山练兵备战，以备不测。此去不知多久，陈兄保重！”
  陈永华感慨道：“王爷在台湾征战，将士死伤病亡十之七八，金厦诸将又不发一船去台湾，国事艰难啊！贤弟你也保重，我已着内人去黄廷处提亲，贤弟且听好消息。”
  朱钰行礼道：“仰仗陈兄了，谢过嫂夫人！”
  战船慢慢的驶离码头，朱钰回首看着愈来愈远的思明州，他知道一场暴风骤雨即将来临，加油吧！朱钰！
  朱钰回到铜山后，召集守岛诸将，把从思明州得来的消息通报给各级军官，又令严加训练，整军备战。把李山、李峰兄弟请来，让其改进火药配方，硝、硫磺、木炭粉比例定为75:10:15。并把颗粒火药这种改进技术改进告诉他们，把粉末状火药重新浸湿，再筛制成大小、成分均匀的颗粒火药。让他们想办法尽快研制出来。如果研制成功颗粒火药，再加上最科学的配方比例，相信火枪、火炮的威力能够大大增加，这是当下争霸天下的资本。
  朱钰把赵来福、蓝彪、刘云峰、陈佳龙、李佑生等留下，命他们从军队中抽出忠实可靠、胆大心细者六十人，组成最早的情报部队，专门负责搜集情报、传播流言、伪报、卧底、防火、暗杀等，由副排长李佑生负责，直接对朱钰负责。朱钰让他们全部剃发，每人给五十两银子，换上普通百姓的服饰，分别潜入漳州、泉州、兴化、漳州、福州、潮州，让他们去府城的茶楼、饭馆、客栈、市井当中传播两个消息。一曰：宋太宗赵光义篡夺了宋太祖赵匡胤的天下，天道轮回，靖康之变后，宋室南渡，宋高宗赵构没有子嗣，传位给太祖七世孙宋孝宗赵眘，南宋才有机会灭掉金国，报仇雪恨。一曰：靖难之役后，建文帝并没有死，而是一直隐藏于闽南，清虏肆虐，崇祯皇帝殉国后，弘光、隆武、邵武政权皆不长久，而永历皇帝又崩于云南，建文一脉将有新皇登基，救万民于水火。
  两个月过去了，期间器械研制所终于按照朱钰的要求试制出颗粒火药，朱钰令火绳枪试射，射程、威力又有三成左右的增加，可以在70米的距离上，击穿双层棉甲。朱钰令全军换装新式火药，并重奖李山、李峰兄弟及工匠们。
  陈永华也让人带来了好消息，永安侯黄廷已经同意这门婚事了。朱钰抽空带着大量聘礼去了趟思明州，心里算了算，郑成功大概还有两个月的时间就会薨于台湾，就跟陈永华商议，形势微妙，事急从权，尽快娶黄雅妮过门，黄廷将军也是爽快之人，就定十日后完婚。
  郑成功派大将周全斌、都督杜辉、殿后镇黄昌去督促南澳陈豹带领军民赴台，陈豹以为郑成功听信谣言诛杀自己，恐惧不已，带领官民向清廷投降。看来，没有自己主动的参与，有些事还是按照原来的历史轨迹发展。
  接下来应该就是郑成功发现郑经私通乳母之事，那时候自己已经把黄雅妮娶到铜山，自己和张进有四镇之兵，并且自己的三个营的战力绝非寻常军队可比，此时的朱钰，就是在跟时间赛跑。
  婚期很快到了，也许是在思明州的郑经及诸将听到什么风声，岛上气氛有点紧张怪异，战船徘徊于外岛、士兵巡逻与岛内。朱钰带着赵来福及娶亲队伍登上思明州，顺利的把黄雅妮娶上船，岳父黄廷还陪嫁了两个丫鬟伺候黄雅妮。
  码头上，陈永华夫妇前来给朱钰夫妻送行，陈永华表情有点怪异，对朱钰道：“贤弟，可听到从清廷那边传来的关于建文帝的消息？”
  朱钰，心里微微一动：“情报人员牛刀初试，还算办成了点事，回去有赏。”接着装出带点疑惑、好奇还有点紧张的表情，说道：“陈兄所说的是指靖难之役中的建文帝吗？”
  陈永华道：“对，我们的商人在多个府城传来消息，有流言暗示建文帝当时没有死，而是逃到了闽南隐居起来，现在还有后人，永历帝崩后，将有新的皇帝登基，驱逐鞑虏，澄清玉宇，这个皇帝据说要出自建文一脉。”
  朱钰突然抬起头来，望向远方，双手负于背后，一副指点江山的模样，陈永华顺着他的目光看去，太阳刚刚跃出海面，万丈金芒洒下，波光粼粼。
  陈永华奇道：“贤弟，你在看什么？”
  朱钰走到陈永华身侧，悄声道：“陈兄，你看我也姓朱，可不可以当这个皇帝？”
  陈永华为之一窒，似乎又想起了什么，说道：“贤弟之才，旷世罕见，听忠匡伯张进说，你在铜山编练了新军，装备了大量的鸟铳，火器犀利，兵强马壮，日后成就不可限量。”
  朱钰扶着陈永华的双臂，笑道：“陈兄过奖了，兄台满腹治世之经纶，实乃安邦治国之才，愚弟不才，唯有一腔热血为苍生、为黎民，不知陈兄可愿同在下一起驱逐鞑虏、匡扶华夏，创立一番丰功伟业？”
  陈永华道：“固所愿也！”
  朱钰偕夫人登船，信风吹起，鼓起的船帆推着战船快速地向着铜山方向驶去，朱钰突然双手做喇叭状，大声喊道：“长风破浪会有时，直挂云帆济沧海，陈兄，后会有期！”
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